Die spätromantische Orgel der St.-Petri-Kirche Flegessen stammt – ebenso wie das heutige neoromanische Kirchengebäude – aus dem Jahr 1892. Errichtet von der
Orgelbaufirma P. Furtwängler & Hammer aus Hannover, entspricht ihre Anlage mit zwölf Registern auf zwei Manualen und Pedal der einer typischen Dorforgel vom Ende des 19. Jahrhunderts mit
vielen reizvollen Klangfarben.